Учёный совет МГГЭУ — выборный представительный орган, осуществляющий общее руководство институтом. Деятельность Учёного совета регулируется Уставом МГГЭУ и Положением об Учёном совете МГГЭУ. Количество членов Учёного совета определяется конференцией работников и учащихся МГГЭУ. В состав Учёного совета входят ректор, который является его председателем, проректоры, а также по решению Учёного совета – деканы факультетов. Другие члены Учёного совета избираются на конференции работников и учащихся МГГЭУ путём тайного голосования. Срок полномочий Учёного совета составляет 5 лет. Досрочные выборы членов Учёного совета проводятся по требованию не менее половины его членов или ректора.

Учёный совет МГГЭУ:

• принимает решения о создании, реорганизации и ликвидации факультетов, кафедр и других учебных и научных подразделений;
• определяет основные направления научных исследований и инновационной деятельности;
• утверждает положение о проведении текущего контроля успеваемости и промежуточной аттестации студентов, а также другие положения по организации и проведению учебного процесса;
• избирает по конкурсу претендентов на замещение должностей научно-педагогических работников МГГЭУ;
• утверждает учебные планы, графики учебного процесса и образовательные программы;
• принимает решения по вопросам представления работников к присвоению учёных званий;
• представляет к почётным званиям и наградам Российской Федерации;
• принимает положение об учёном звании почётного профессора МГГЭУ;
• рассматривает другие важнейшие вопросы, связанные с образовательной, научной и иной деятельностью.

Состав учёного совета МГГЭУ:

• Михалёв Игорь Васильевич – ректор, председатель Ученого совета;
• Агейчева Татьяна Евгеньевна – проректор по молодёжной политике;
• Сахарчук Елена Сергеевна – проректор по учебно-методической работе;
• Червинская Александра Павловна – проректор по общим вопросам;
• Шапиев Сиябшах Магомедович – проректор по административно-хозяйственной работе и безопасности;
• Азаев Гаджимурад Гаджиевич – начальник управления кадров;
• Ахтырская Валентина Александровна – заведующий библиотекой;
• Ведров Александр Анатольевич – заместитель генерального директора по производственно-технологической политике в АО «Концерн ВКО «Алмаз – Антей»;
• Гуров Григорий Александрович – заместитель Министра науки и высшего образования Российской Федерации;
• Довнар Алексей Николаевич, магистрант 1 курса факультета юриспруденции;
• Пудов Андрей Николаевич – статс-секретарь, заместитель Министра труда и социальной защиты;
• Руденко Игорь Леонидович – декан факультета психологии и педагогики;
• Рязанский Валерий Владимирович, председатель Общероссийской общественной организации «Союз пенсионеров России», кандидат экономических наук;
• Стрелков Игорь Николаевич, начальник Управления по административно-хозяйственной работе;
• Хакимов Руслан Мадаминджанович – декан факультета юриспруденции.
• Петровская Мария Владимировна – проректор по науке.